105. Яковенко О.Я., Голуб А.Г., Бджола В.Г., Ярмолюк С.М. Интеграция молекулярной динамики и докинга для предсказания биологической активности химических соединений.


Чтобы посмотреть этот PDF файл с форматированием и разметкой, скачайте файл и откройте на своем компьютере.
1 РОССИЙСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК Отделение химии и наук о материалах Институт геохимии и аналитической химии им. В. И. Вернадского Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, химический факультет 3 - я Всероссийская конференция "Молекуляр ное моделирование" 15 - 17 апреля 2003 г. Москва, 2003 г. 2 ОРГКОМИТЕТ 3 - й Всероссийской конференции "МОЛЕКУЛЯРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ" Сопредседатели Оргкомитета: Член - корр. РАН Грибов Л.А. Академик Зефиров Н.С. Члены Оргкомитета: Академик РАМН Арчаков А.И. Проф. Баранов В.И. Проф. Бачурин С.О. Проф. Дементьев В.А . Проф. Кузнецов П.Е. Проф. Папулов Ю.Г. Проф. Проскурлина М.В. Проф. Эляшберг М.Е. К.х.н. Палюлин В.А. Ученый секретарь: К.ф. - м.н. Жогина В.В. 3 ПРОГРАММА КОНФЕРЕНЦИИ  15 апреля Утреннее заседание 10.00 Открытие конференции 10.10 Зефиров Н.С. Современные аспекты QSAR 11.10 Грибов Л.А. Молекулы как информационные приемно - преобразующие системы 12.10 Баранов В.И. Моделирование межизомерных стр уктурных преобразований молекул. Вероятности переходов и их температурные зависимости 12.30 Кузьмин В.Е., Артеменко А.Г., Челомбитько В.А., Ляховский А.В., Желтвай А.И., Полищук П.Г. Иерархическая система моделей QSAR (1 D - 4 D ) на базе симплексного представ ления молекулярной структуры 12.50 - 14.00 Перерыв Вечернее заседание 14.00 Беленикин М.С., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Молекулярное моделирование лиганд - рецепторных комплексов метаботропных глутаматных рецепторов 14.20 Дементьев В.А. Опыт молекулярног о моделирования с использованием суперкомпьютера МВС - 1000 14.40 Егоров В.В. Электродинамика протяженных многофононных переходов 15.00 Комиссаров Г.Г. Моделирование фотосинтеза 15.20 Молчанова М.С., Трач С.С., Зефиров Н.С. Направленный поиск новых типов орг анических реакций с помощью программы ARGENT - 1: первые результаты 15.40 Ефремов Р.Г. Пептиды и белки в мембранах: анализ структуры, динамики, функции в вычислительных экспериментах 16.00 - 18.00 Стендовая секция ( доклады №№ 1 - 35 )  Время на доклады: пленарные – 40 мин + 20 мин для ответов на вопросы устные – 15 мин + 5 мин для ответов на вопросы 4 16 апреля Утренне е заседание 10.00 Арчаков А.И., Иванов А.С., Дубанов А.В. Верификация молекулярного моделирования белков в качестве мишени для действия лекарств 11.00 Саркисов О.М. Фемтохимия элементарных процессов 12.00 Новосадов Б.К., Кочиков И.В., Тарасов Ю.И. Модел ирование термически средней плотности распределения межъядерных расстояний многоатомных молекул 12.20 Пиоттух - Пелецкий В.Н. Новые возможности информационной системы по ИК спектроскопии при решении спектроструктурных задач 12.40 - 14.00 Перерыв Вечернее заседание 14.00 Поройков В.В. Био - и хемоинформатика белков - мишеней новых лекарств 14.20 Тарасов Ю.И., Кочиков И.В., Курамшина Г.М., Новосадов Б.К., Саакян А.С. Моделирование совокупности структурных экспериментальных данных на основе параметров п отенциальных функций 14.40 Долгоносов А.М. Неэмпирический расчет адсорбции и предсказание удерживания в газовой хроматографии по строению молекул 15.00 Эляшберг М.Е. , Блинов К.А., Молодцов С.Г., Мартиросян Э.Р., Вильямс А. Установление структуры природны х соединений по ограниченным 2М ЯМР данным с помощью системы STRUCTURE ELUCIDATOR ( StrucEluc ) 15.20 Новаков И.А., Павлючко А.И., Орлинсон Б.С., Корольков В.В. Применение комплексного квантово - химического и спектроскопического метода для изучения реакцион ной способности аминов в конденсированном состоянии 15.40 Суханов Л.П., Перевалов Д.А. Моделирование молекулярных эффектов при - распаде трития неэмпирическими методами квантовой химии 16.00 - 18.00 Стендовая секция ( доклады №№ 36 - 70 ) 5 17 апреля Утреннее заседание 10.00 Палюлин В.А., Баскин И.И., Зефиров Н.С. Молекулярное моделирование и конструирование лекарств 11.00 Захарьев Б.Н., Чабанов В.М. Послушная квантовая механика: Н овый статус теории в подходе обратной задачи 12.0 0 - 13.00 Перерыв 13.00 - 15.00 Стендовая секция ( доклады №№ 71 - 105 ) Круглый стол 6 СТЕНДОВАЯ СЕКЦИЯ 1. Авакянц Г.С., Комиссаров Г.Г. Компьютерное моделирование переноса электронных возбуждений в фотосинтетической единице: вклад векторной и броуновс кой компонент. 2. Алексеев Е.В. Применения метода функционала плотности при безэталонном количественном спектральном анализе. 3. Алифанова Е.Н., Лапина О.Ю., Субботин В.А. Квантовохимическое исследование механизма образования и разложения анионных - аддуктов аренов в газовой фазе и растворе. 4. Арабей С.М., Станишевский И.В., Соловьев К.Н. Моделирование реакции фотодеструкции металлопорфиринов в полимерной матрице. 5. Арефьева О.А., Кузнецов П.Е., Толмачев С.А., Купадзе М.С., Хлебцов Б.Н. Молекуля рная динамика и экспериментальные модели липосахарида бактерий Azospirillum brasilence SP 245 и полисахарид - полисахаридного взаимодействия. 6. Бабков Л.М., Ведяева Е.С., Пучковская Г.А. Проявление конформационной подвижности и специфического межмолекулярного в заимодействия в инфракрасных спектрах триторбутилциклогексанкарбоновой кислоты. 7. Бабков Л.М., Гнатюк И.И., Пучковская Г.А., Трухачев С.В. Моделирование ИК спектров, строение и конформационная подвижность 4' - n - алкил - 4 - цианобифенилов. 8. Бакурадзе Р.Ш., Ананиашв или В.О., Джапаридзе К.Г. Квантово - химическое моделирование некоторых электропроводящих полимеров. 9. Беленикин М.С., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Молекулярно - динамические расчеты поведения агонистов и антогонистов в лиганд - рецепторных комплексах аминоконцевых доменов метаботропных глутаматных рецепторов разных групп. 10. Беленикин М.С., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Молекулярно - динамические расчеты лиганд - рецепторных комплексов ионотропных ( AMPA подтип) глутаматных рецепторов. 11. Беленький Л.И., Суслов И.А., Чувылкин Н.Д . Влияние стабильности ониевых состояний азота, кислорода, серы и селена на позиционную селективность производных пятичленных гетероциклов с одним гетероатомом в реакциях электрофильного замещения. 12. Березин К.В., Татаренко О.Д., Нечаев В.В. Расчет неплоских колебаний молекулы порфина. 13. Берзигияров П.К., Заец В.А., Гинзбург И.Я., Разумов В.М., Шека Е.Ф. NANOPACK и NANOVIBR : параллельные коды для полуэмпирических квантово - химических вычислений и расчетов гармонических колебаний больших систем. 7 14. Богданова Т.Ф., М акаров Л.И., Пиоттух - Пелецкий В.Н. Распознание крупного фрагмента соединения на основе таксономии структур поискового ответа. 15. Бондаренко Е.А., Иванов Ю.В., Вовна В.И. Квантово - химические расчеты - дикетонатных комплексов кобальта ( II ) . 16. Брусков В.П. Квантово - химическое моделирование таутомерных превращений флавон - 3 - олов. 17. Бурова Т.Г., Тен Г.Н., Кучерова В.В. Квантово - механический анализ спектров резонансного комбинационного рассеяния молекул простейших оснований нуклеиновых кислот. 18. Буряк А.К. Применение молекулярно - статистических расчетов для моделирования внутримолекулярных превращений адсорбированных молекул. 19. Васильев П.М., Горлов И.Ф., Юрина О.С. Прогноз фармакологической активности многокомпонентных смесей органических соединений в ин формационной технологии "Микрокосм". 20. Васильев Р.Ф. Моделирование термолиза пероксидов и возбуждения хемилюминесценции продуктов полуэмпирическими методами квантовой химии. Локальные минимумы, случайные ошибки, способы их уменьшения. 21. Виноградова М.Г., Папул ов Р.Ю., Михайлова Ю.А., Нилов Д.Ю. Перечисление изомеров замещения спиропентана. 22. Гастилович Е.А., Королькова Н.В., Клименко В.Г., Серов С.А., Нурмухаметов Р.Н. Влияние спин - орбитальной связи в атомах гетероциклических аналогов флуорена на дипольные момент ы перехода T i → S 0 . 23. Гафуров У. Молекулярная модель ползучести высокоориентированных линейных кристаллических полимеров. 24. Гришина М.А., Потемкин В.А., Русинов Г.Л., Слепухин П.А. Теоретическое исследование реакций нуклеофильного замещения солей 1 - алкил - 2 - морфо лил - 3 - хлорпиразиния C - нуклеофилами в присутствии оснований. 25. Гугава М.Т., Павленишвили И.Я., Джапаридзе К.Г. Моделирование синтеза спирохроменов на основе некоторых аналогов оснований Фишера. 26. Гучик И.В., Фролов Ю.Л., Шагун В.А., Трофимов Б.А. Квантовохимич еский анализ механизмов образования сверхосновных сред типа "гидроксид щелочного металла - вода - диметилсульфоксид" ( MOH - H 2 O - ДМСО), где M = Li , Na , K . 27. Дмитриев А.В., Барышников В.Г. О движении ионов в порообразующих белковых молекулах. 28. Дмитрук А.Ф., Заречная О. М., Опейда И.А. Природа переходного состояния реакции рекомбинации пероксильных радикалов. 8 29. Емелина Т.Б., Щека О.Л. И спользование квантовохимического метода – ДВ для изучения электронного строения и химических свойств платиновых катали заторов. 30. Желтвай А.И., Кузьмин В.Е., Челомбитько В.А., Алиханиди С.Э., Ляховский А.В. Стереохимический анализ хиральных ароматических полиэдров. 31. Житов А.Н., Лебедев М.В., Супрун И.П., Иванов С.Г. Исследование возможностей генетического алгоритма для решени я задачи многокомпонентного анализа газовых смесей по дистанционным ИК спектрам поглощения атмосферы. 32. Завалий М.В. Моделирование динамических вибронных спектров сложных молекул с учетом межизомерных переходов. 33. Зволинский В.П., Годик В.А. Квантовохимическое моделирование спектрально - люминесцентных и генерационнных характеристик молекулы 2,2' - битиенил - 1,3,4 - оксадиазола в растворителях различной природы. 34. Иванова А.А., Иванов А.А., Олиференко А.А., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Построение универсальной QSPR - модел и для разнородной выборки органических соединений. 35. Иванов А.А., Баскин И.И., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Сравнительный анализ структуры аденозиновых рецепторов и механизмов связывания их лигандов. 36. Иванов А.А., Кочиков И.В., Новосадов Б.К., Рыков А.Н., Степа нова А.В., Тарасов Ю.И. Моделирование интенсивности рассеяния электронов на струе пара молекул с движением большой амплитуды. 37. Иванов Ю.В., Вовна В.И. Неэмпирические квантовохимические расчеты спектров фотоионизации дикетонатных комплексов Ni . 38. Калниньш К.К. , Семенов С.Г. Синглетные S 1 и триплетные T 1 бирадикальные состояния этилена и его производных. 39. Кацюба С.А., Вандюкова Е.Е. Квантово - химическое моделирование колебательных спектров как метод исследования структуры молекул. 40. Киреев А.Ф., Каюков А.П. Обоснова ние подхода к теоретическому расчету масс - спектра - дихлоридэтилсульфида на основе квантово - химического полуэмпирического метода PM - 3 и расчетного ИК - спектра. 41. Королевич М.В., Жбанков Р.Г., Пиоттух - Пелецкий В.Н., Дерендяев Б.Г. Моделир ование ИК спектров углеводов. 42. Косарев А.В., Мельников Г.В. Функция распределения молекул спирта в мицелярных ассоциатах. 43. Кузнецова Н.Б., Кузнецов П.Е., Согуренко И.А. Дибензо - пара - диоксины – катализаторы образования перекиси водорода. 44. Кузнецов П.Е. Дескрип торы микроокружения в задачах QSAR . 9 45. Кузьмин В.Е., Огниченко Л.Н., Артеменко А.Г., Ляховский А.В. Прикладные возможности концепции информационного поля молекулы. 46. Кунцевич А.Д., Писковский С.В., Новиков С.С., Матюшин Ю.Н., Селезнев П.А., Вьюнова И.Б. О класс ификации химических соединений, необходимой при разработке базы данных для внеэкспериментального прогноза зависимости биологической активности от структуры химического соединения. 47. Лагунин А.А. Количественный анализ зависимостей структура - спектр активности - величина эффекта для ингибиторов эндотелин - превращаюшего фермента с применением самосогласованной регрессии. 48. Лебедев К.С., Строков И.И. Моделирование процессов фрагментации органических молекул под действием ионизирующего излучения. 49. Лобанов А.В., Комиссаро в Г.Г. , Холуйская С.Н. О роли H 2 O 2 в экспериментах, моделирующих абиогенный синтез органических веществ. 50. Мелихов Н.А., Шмелев Р.В., Дмитриев А.В., Барышников В.Г. О распределении молекулярного электростатического потенциала в полости порообразующих белков. 51. Мельников Г.В., Косарев А.В. Моделирование триплет - триплетного переноса энергии электронного возбуждения в водно - мицелярных растворах. 52. Морозова Т.А., Крылов А.В., Белов А.П. Структурная нежесткость - аллильного комплекса палладия на основе сорбиновой кислоты. 53. Морозов В.А. , Дубина Ю.М. Смешанное квантово - классическое моделирование внутримолекулярной динамики при преобразовании света молекулами. 54. Муравьев Г.А. Взаимодействие двух атомов на расстояниях, сравнимых с их размерами . 55. Муратов Е .Н. , Кузьмин В.Е., Камалов Г.Л., Котляр С.А., Григораш Р.Я., Шишкин О.В., Шишкина С.В. Модели для анализа структурного подобия конформаций макроциклов. 56. Муштакова С.П., Варламова Т.М., Герасимова Г.В., Юрина Е.С. Квантово - химическое моделирование строения к омплексов щелочных металлов с апротонными растворителями. 57. Новиков С.С., Писковский С.В., Лебедев В.П., Селезнев В.А. Оценка термодинамических и кинетических параметров при расчетном моделировании активных центров ферментов и рецепторов некоторых физиологич ески активных соединений. 58. Новосадов Б.К. Использование интегрального уравнения для теории возмущений при моделировании ангармонических колебательных спектров молекул. 59. Новосадов Б.К., Кочиков И.В., Тарасов Ю.И. Моделирование ангармонических силовых констант многоатомных молекул методом масштабирования результатов неэмпирических расчетов. 10 60. Осипов А.Ю., Иванов Ю.В., Вовна В.И. Расчет фотоионизационных спектров фторированных производных ацетилацетоната Cu и Ni . 61. Павич Т.А., Арабей С.М. Моделирование фотохимически х превращений бисантена и его фенилпроизводных. 62. Панюшкин В.Т., Сухно И.В., Бузько В.Ю., Ковалева И.А. Моделирование магнитно - релаксационных свойств и состояния акваиона Ga (3+) в водных растворах электролитов. 63. Папулов Ю.Г., Виноградова М.Г., Басалаева П.С. Комбинаторный анализ в химии. 64. Погребняк А.В. MATRIX - новый алгоритм прогнозирования биологического действия органических молекул, основанный на многомерном анализе физико - химических дескрипторов современных лекарственных препаратов. 65. Потемкин В.А., Гришина М.А., Гуччионе С., Перспикаче С. Определение ориентации ДНК антиметаболитов в полости реального рецептора в рамках 3 D QSAR метода BiS . 66. Рогачева С.М., Кузнецов П.Е., Злобин В.А., Назаров Г.В., Грачева А.А., Согуренко И.А. К вопросу о физической природе дей ствия сверхнизких концентраций – эксперимент и теория. 67. Рыбальченко И.В., Павлючко А.И., Сигейкин Г.И., Киреев А.Ф., Суворкин В.Н. Квантово - химическое моделирование ИК - спектров фосфорорганических соединений с точностью, необходимой для их спектральной идент ификации 68. Рыжов А.Н., Лапидус А.Л., Словохотова О.Л., Смоленский Е.А., Чуваева И.В., Зефиров Н.С. Расчеты топографических индексов Винера для алканов. 69. Рыжов А.Н., Маслова Л.К., Смоленский Е.А., Лапидус А.Л., Зефиров Н.С. Моделирование температур плавления н ормальных алканов. 70. Рябченко О.Б., Слабженников С.Н., Куартон Л.А. Исследование характеристик связи металл - лиганд в трис - ацетилацетонатных комплексах переходных металлов и металлов III - A группы методами ИК - спектроскопии и квантовой химии. 71. Садым А.В., Лагуни н А.А., Филимонов Д.А., Поройков В.В. Интернет - ресурс для прогноза спектра биологической активности ХС. 72. Салтыкова М.Н., Виноградова М.Г., Чернолецкий К.В., Смоляков В.М. Моделирование свойств замещенных метилсилана в атом - атомном представлении. 73. Сальников А .Н., Спивак А.В., Мельников Г.В. Кинетика процессов дезактивации энергии электронного возбуждения молекул пирена, иммобилизованных в полисахаридные матрицы. 74. Скворцова М.И., Федяев К.С., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Базисные топологические дескрипторы и их пр именение для построения корреляций "структура - свойство". 11 75. Скворцова М.И., Федяев К.С., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Обратная задача в проблеме связи "структура - свойство" для случая корреляционных уравнений, содержащих базисные топологические дескрипторы. 76. Смол енский Е.А., Камерницкий А.В., Маслова Л.К., Зефиров Н.С. Применение дескрипторного анализа для моделирования влияния минералокортикоидов на Na + , K + - зависимую АТР - азу. 77. Смоленский Е.А., Шпилькин С.А., Чуваева И.В., Чувылкин Н.Д. Моделирование геометрических корреляционных эффектов ступенчатыми функциями. 78. Солкан В.Н., Кузьмин И.В. Исследование методом функционала плотности присоединения трет - бутильного катиона к изобутену, 1 - бутену и 2 - бутену в среде жидкой HF . 79. Соловова Н.В., Курбатова С.В. Компьютерная систе ма прогнозирования "структура - свойство". 80. Соловьев А.Н., Баранов В.И. Моделирование возбужденных состояний и вибронных спектров аценов. 81. Сударушкин С.К. Моделирование действия аналитических реагентов с полиэлементным детектированием 82. Сударушкин С.К., Гусакова Н.Н. Молекулярное моделирование для оценки ароматических альдегидов как органических реагентов на первичные ароматические амины. 83. Сухно И.В., Бузько В.Ю., Панюшкин В.Т., Арутюнян М.М. Учет влияния фоновых электролитов на константы устойчивости комплексных соединений при моделировании гидрохимических процессов. 84. Тен Г.Н., Бурова Т.Г., Баранов В.И. Моделирование структуры пурина в различных фазовых состояниях. 85. Тимофеева З.Ю., Егорова А.Ю. Моделирование реакционной способности 3Н - пиррол - 2 - онов и 3Н - фуран - 2 - онов в условиях конденсации Михаэля. 86. Ткаченко О.Ю., Белов А.П. Компьютерное моделирование внутрисферных превращений в  3 - аллильных комплексах палладия с аминами. 87. Трач С.С., Молчанова М.С., Зефиров Н.С. Реализация дискретной контрамоции в алгоритмах генерации о рганических структур и реакций. 88. Трач С.С., Молчанова М.С., Зефиров Н.С. О регулярности вырожденных процессов: классификация вырождения и ее применение для целей систематического поиска новых типов органических реакций. 89. Тупицын Е.Н., Березин К.В., Березин В .И. Квантовые модели и спектральные свойства монозамещенных бензола. 90. Туровский Н.А., Опейда И.А., Николаевский А.Н., Антоновский В.Л. Супрамолекулярная модель реакции каталитического распада органических пероксидов, активированного ониевыми солями. 12 91. Филимон ов Д.А. Компьютерная оценка свойств химических соединений с использованием неполной эмпирической информации. 92. Фоменко А.Е., Соболев Б.А., Филимонов Д.А., Поройков В.В. Применение структурных MNA - дескрипторов для поиска сходства аминокислотных последовательн остей белков. 93. Фролов Ю.Л., Гучик И.В. Квантовохимическое исследование внутримолекулярного вращения метилтиогруппы в молекуле тиоанизола. 94. Фурер В.Л., Коваленко В.И., Борисоглебская Е.И. Расчет интенсивностей полос в ИК спектрах и конформационный анализ кали кс[4]аренов. 95. Хромов А.И., Артеменко А.Г., Кузьмин В.Е. Специализированная СУБД для решения задач 1 D - 4 D QSAR / QSRP . 96. Чистяков А.Л., Станкевич И.В. О проблеме стабилизации - связей в комплексах фуллерена C 60 с атомами переходных металлов. Моделирование методом DFT - PBE структуры и электронного строения комплексов ( M = Fe , Ru , Os ). 97. Чистяков А.Л., Станкевич И.В., Гамбарян Н.П., Ахрем И.С. Изучение активации метана и пропана методом DFT . 98. Шамсиев Р.С., Белов А.П. Квантово - химическое моделирование путей образования пи - комплексов этилена с тетрахлоропалладатом (2 - ). 99. Шамсиев Р.С., Белов А.П. Взаимодействие аллилхлорида с тетракарбонилами никеля и палладия (квантово - химическое моделирование). 100. Шека Е.Ф. Являются ли фуллерены пол ирадикалами? 101. Шека Е.Ф., Заец В.А., Каманина Н.В. О виртуальном и реальном переносе заряда в межмолекулярных комплексах на основе фуллеренов. 102. Элькин М.Д., Ведяева С.Ю., Элькин П.М. Теоретическое исследование колебательных спектров и электронной структуры по лихлорированных дибензо - п - диоксинов. 103. Элькин М.Д., Ведяева С.Ю., Успенский К.Е. Моделирование колебательных спектров - хлорвинилдихлорарсина (люизита). 104. Юхневич Г.В., Тараканова Е.Г., Цой О.Ю. Перенос протона в системе ДМФА - HCl кислота по данным ab initio расчетов. 105. Яковенко О.Я., Голуб А.Г., Бджола В.Г., Ярмолюк С.М. Интеграция молекулярной динамики и докинга для предсказания биологической активности химических соединений.

Приложенные файлы

  • pdf 37806429
    Размер файла: 204 kB Загрузок: 0

Добавить комментарий